Trotzdem ist Leo weiterhin meist bei den mächtigen Dreien auf der Erde, um Nachforschungen über seine Verbannung nach Walhalla anzustellen. Der neue Wächter des Lichts der Mächtigen Drei, Chris Perry (Drew Fuller) erscheint auf den ersten Blick zwielichtig; ist er, was er vorgibt zu sein? Phoebe erkennt in einer Vision als erste, dass Chris Pipers zweiter Sohn ist und als Chris offenbart, dass Leo sein Vater ist, tut sich das Problem der Zeugung auf, denn Leo und Piper sind ja kein Paar mehr. Außerdem gibt Chris zu, dass er nur aus der Zukunft zurück gekommen ist, um zu verhindern, dass Wyatt böse wird.

Phoebes Beziehung mit ihrem Chef bei der Zeitung, Jason Dean (Eric Dane), scheitert ebenso wie Paiges Beziehung zu dem Hexer Richard (Balthazar Getty) an der Magie.

Mitte der sechsten Staffel erscheint Gideon (Gildart Jackson) zum ersten Mal. Er ist ein Ältester und Leos Mentor. Gideon war einer der Befürworter für die Hochzeit zwischen Leo und Piper. Dies bereut er jedoch bald, da er die Ansicht vertritt, dass Wyatt eine zu große Bedrohung für die Mächte des Guten ist. Des Weiteren ist Gideon der Leiter der Magie-Schule. Er wird am Ende der sechsten Staffel von Leo vernichtet, als dieser erfährt, dass Gideon Wyatt umbringen will. Die Folgen seiner Taten reichen jedoch weit in die siebte Staffel hinein. Nachdem er seinen ersten Zug macht, um Wyatt zu töten, kommen Piper und Leo wieder zusammen – Chris wird in dieser Nacht gezeugt.

Ein weiterer wichtiger Charakter, der in der sechsten Staffel zum ersten Mal auftaucht, ist Detective Sheridan (Jenya Lano). Ihretwegen kam Darryl einem „dauerhaften“ Tod näher als jemals zuvor und trennt sich deswegen anschließend von den Mächtigen Drei. Um ihm das Leben zu retten, machen die Mächtigen Drei wieder einmal das Unmögliche möglich, was jedoch zur Folge hat, dass der Dämon Barbas wieder befreit wird.

Am Ende der sechsten Staffel kommt es nach mehreren traurigen und schmerzhaften Ereignissen doch noch zu einem Happy End. Chris kommt in dieser Doppelfolge, trotz Komplikationen bei Piper, gesund zur Welt. Doch der Chris aus der Zukunft stirbt durch Gideon. Barbas ist nach wie vor „auf freiem Fuß“.

Zu einem handfesten "Skandal" kam es wenige Tage vor dem Drehstart der sechsten Staffel, nachdem sich Alyssa Milano ihre vormals langen Haare ohne Rücksprache mit den Produzenten raspelkurz abschneiden ließ. Dies wurde dann letztlich dadurch gerettet, dass Phoebe in einer der ersten Szenen von ihrer Schwester mit den Worten "oh, ein neuer Haarschnitt - gefällt mir ausgesprochen gut" begrüßt wurde.

Episodentitel:

Deutsch:

6x01: Im Bann der Walküren 1

6x02: Im Bann der Walküren 2

6x03: Vergissmeinnicht

6x04: Die Ohnmacht der Drei

6x05: Tödliche Liebe

6x06: Opfer der Sehnsucht

6x07: Seelenqualen

6x08: Piper und die Tafelrunde

6x09: Kleine Monster

6x10: Zwischen den Zeiten

6x11: Witchstock

9x12: Der perfekte Mann

6x13: Schlechtes Karma

6x14: Die kopflosen Drei

6x15: Bezaubernde Phoebe

6x16: Piper und Leo

6x17: Klassentreffen

6x18: Die Spinne

6x19: Das Tribunal

6x20: Magische Männer

6x21: Wirch Wars

6x22: Gute und böse Welt - Teil 1

6x23: Gute und böse Welt - Teil 2